Основные принципы работы факультета – обучение через участие в самостоятельной исследовательской работе, обращение к антропологическим проблемам с использованием современного инструментария. Обучение на факультете сочетает в себе идеи и методы современной этнографии, социальной антропологии, фольклористики и лингвистической антропологии. Чаще всего исследования магистрантов и аспирантов посвящены изучению того или иного сообщества (например, этнической, религиозной, профессиональной группы, группы носителей определенного языка), практик, представлений и дискурсов, общих для этой группы.

Важнейшей составляющей научной деятельности преподавателей и студентов факультета антропологии являются полевые исследования. На факультете существует уникальная система обучения методам полевой работы и обсуждения полевых материалов. За последние годы полевая работа проводилась от о. Шпицберген и Командорских островов до Нигерии и Эфиопии.

Факультет поддерживает контакты с Университетом Оксфорда, Университетом Париж — Сорбонна, Университетом Тромсё (Норвегия), Университетом Аляски (Фэрбенкс, США), Университетом Торонто и другими исследовательскими центрами.